2026年4月15日，由中国医学装备协会基因检测分会、医疗辅助技术（医学检验）国家临床医学研究中心、中华医学会检验医学分会临床微生物学组联合制定的 《宏基因组高通量测序技术临床实验室规范化应用指南（2026版）》 正式发布。
这是继2020—2025年多部mNGS相关共识之后，首部系统覆盖 “湿实验+干实验”全流程、以实验室规范化建设为核心的指南性文件，标志着我国mNGS临床检测从“能用”向“规范用”室之间的结果差异大，临床解读困难重重。“技术越强，规范越急”。此次指南的出台，正是为了解决实验室在环境分区、人员资质、试剂耗材、软件数据库、质控体系、性能确认、结果判读**等方面的现实痛点。
指南围绕15个关键问题，形成15条推荐意见（其中14条为“建议”，1条为“考虑”），以下为IVD从业者最应关注的内容： 1. 明确预期用途（推荐意见1） 实验室开展的mNGS检测项目需有明确的临床预期用途，包括疾病类型/症候群、标本类型、适用人群、检测核酸类型（DNA/RNA）及临床意义。 解读：不能“为了测而测”，每项mNGS产品/方法必须有清晰的临床定位。 2. 实验室分区与流向（推荐意见2） 应设置试剂准备区、标本制备区、文库制备区、文库扩增区（如适用）、测序区，单一流向。 血液/脑脊液等无菌标本与下呼吸道等有菌标本的提取应在不同区域或不同批次。 不推荐与常规PCR共用区域；如确需共用，必须按mNGS标准管理。 解读：污染是mNGS的头号敌人，分区和流向是硬性门槛。 3. 人员资质（推荐意见3） 人员必须通过省级以上指定机构组织的基因扩增检验技术培训，并通过内部制度化培训考核。 解读：mNGS不是普通PCR，人员能力要求更高，培训必须“双保险”。 4. 仪器设备（推荐意见4） 新测序仪安装后需进行安装确认，更换仪器后需用已知样本平行检测，结果一致方可使用。每次实验后必须有仪器清洁程序。 解读：测序仪的“身份证”和“体检报告”缺一不可。 5. 试剂、耗材、软件、数据库（推荐意见5） 每批次试剂必须进行背景微生物确认。 耗材需有控菌措施（如高压灭菌、滤芯吸头）。 软件更新后必须用至少3个旧数据重新验证。 数据库原则上非必要不更新；若更新，必须用至少10个旧数据验证，覆盖细菌、真菌、DNA/RNA病毒、寄生虫。 解读：数据库一换，结果天差地别——这是很多实验室忽视的“隐形炸弹”。 6. 标准化操作程序（SOPs）（推荐意见6） 应建立与常规方法（培养、PCR、快速检测、血清学）相结合的临床检验路径，明确何时启动mNGS。SOPs须覆盖分析前、中、后全流程，包括cut-off值建立。 解读：mNGS不是“万能替代”，而是“补充精装”——先用常规，再上mNGS，这是临床落地的最佳实践。 7. 标本采集、运输、接收、保存（推荐意见7） 必须在洁净区域采集，使用无菌、去核酸的采集管，采集后立即密封、一次性封装。实验室须建立标本质检程序，不合格标本需明确处理流程（拒收、重采或让步检测）。 解读：标本质量决定结果质量，很多假阴性源于采集运输环节的“坑”。 8. “湿实验”流程（推荐意见8） 须监测核酸提取浓度、文库浓度、测序数据量、Q30等关键质量值。 解读：不能只看最终有没有病原体，中间每一步的“质量值”才是可控性的体现。 9. “干实验”流程（推荐意见9） 必须建立覆盖原始数据质控→宿主序列过滤→物种注释的SOPs，明确软件版本、参数、数据库版本及质量值要求（如过滤后有效数据量、非宿主数据占比等）。 解读：生信不是“黑箱”，每一步都必须可追溯、可质控。 10. 结果判读：阳性判断值与背景数据库（推荐意见10） 必须使用具有阳性判断值（cut-off值）的mNGS方法，可通过ROC曲线建立。同时必须建立背景微生物数据库（涵盖试剂、环境、耗材），用于排除外源污染导致的假阳性。结果判读原则：先按cut-off判阴阳，再排除背景污染，最后给出最终结果。 解读：没有cut-off的mNGS就是“耍流氓”；不建背景库，假阳性满天飞。 11. 参考物质（推荐意见11） 临床标本难以大量获得时，可使用模拟样本（含人源核酸+病原体核酸，基质与临床一致）。干实验可采用计算机模拟数据。 解读：参考物质是性能确认、质控、室间质评的“标尺”，不能随意凑合。 12. 性能确认（推荐意见12） 对每一类病原体（DNA病毒、RNA病毒、革兰阳性菌、革兰阴性菌、真菌、寄生虫）选择代表性菌株，验证精密度（重复性+重现性）、分析灵敏度（LoD）、分析特异性、准确度、交叉污染。 三种可简化情形： mNGS仅作为补充检测； 曾做过完整性能确认（仅修改cut-off需重做）； 阳性结果均采用另一种方法（NMPA批准试剂或经过验证的自建方法）确认。 解读：性能确认是合规的“入场券”，但指南给出了灵活通道，避免过度“内卷”。 13. 室内质量控制（推荐意见13） 阳性质控品：每批检测弱阳性（1.5~3倍LoD），覆盖多类病原体。 阴性质控品：监测外源污染，失控需分析原因。 内参：每个标本加外源性内参，监测检测有效性。 标签（UDI）：监测交叉污染。 定期进行擦拭实验（Swipe tests）监测实验室表面污染。 解读：质控不是“做样子”，内参+阴阳性对照+标签+环境擦拭，四重防线。 14. 室间质量评价（推荐意见14） 定期参加EQA/PT；如无，与至少两家外部实验室进行比对。 解读：闭门造车不可取，EQA是发现系统性问题的“照妖镜”。 15. 结果报告与解释（推荐意见15） 报告至少包含：患者信息、标本信息、检测信息、实验室信息、结果信息（病原体名称、丰度参数如RPM、耐药基因如适用）。不推荐常规报告测序深度等过程参数。结果解释必须结合临床，阴性不能排除感染，耐药基因需谨慎解读。 解读：报告不是数据堆砌，要让临床医生看得懂、用得上。 ※指南的行业意义 1. 填补了“实验室规范化”的空白：以往共识多聚焦临床应用，这次聚焦实验室自身建设，直击“操作不规范、结果不可靠”的痛点。 2. 强调污染控制与背景数据库：首次明确提出每批次试剂背景确认、定期擦拭实验、建立本地背景微生物库，这是mNGS质量保证的“生命线”。 3. 性能确认给出简化路径：避免了“一刀切”式的过度验证，尤其利好开展补充检测或已有完整验证的实验室。 4. 结果判读回归临床：cut-off+背景库+临床沟通，三管齐下，减少“假阳性恐慌”和“假阴性漏诊”。 ※对IVD企业的影响 试剂盒开发：必须配套明确cut-off值和背景数据库建立方法，不能只卖“通用方案”。 自动化仪器：交叉污染验证（强阳性+阴性交叉模式，连续5批）成为标配。 生信软件：更新验证要求提高，数据库版本管理成为监管重点。 参考物质：模拟样本市场需求将显著增长，特别是含人源背景、片段化cfDNA模拟血浆等。 ※结语 2026版mNGS规范化指南，是国内感染病原宏基因组检测领域从“野蛮生长”走向“精耕细作”的重要里程碑。对于IVD从业者而言，这既是一次合规挑战，也是一次能力分化的机遇。 声明：本文所用视频、图片、文字部分来源于互联网，版权属原作者所有。如涉及到版权问题，请及时和我们联系，核实后协商处理或删除。
